高效过滤空气净化器能够有效地吸附过敏物质，例如，过滤0.3微米的细小颗粒。这类空气净化器通常用在医院和其它医疗场所。虽然空气净化器中的过滤器一般寿命长达几年，但是我们还是建议每年更换两次。虽然高效过滤净化器比其他类型的过滤器噪音大，但其消除的污染物更多。高效过滤净化器不能消除香烟或者雪茄的烟味、异味或者烟雾，因此这种过滤器常常和其他过滤器一同使用，例如活性炭过滤器。
臭氧型空气净化器能够清除异味，但是却不能清除空气中的过敏物质或者化学污染物。臭氧型空气净化器的使用还存在争议。美国国家环境保护局认为臭氧可能对身体健康有害。甚至有人认为，吸入臭氧可能会对肺部造成损害。通常，臭氧会导致呼吸状况恶化，例如发生哮喘。
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