《指南》指出，本年度课题申报指南的编制应遵循以下原则：
一是落实科技重大专项中期评估聚焦调整意见。结合国家重点工程、重大专项的集中需求和良好的应用基础，加强顶层设计，集中开展数控机床专项成果在航空航天、汽车、机床等重点领域的应用验证，大力推进国产数控系统、功能部件和刀具的研发和配套应用。
二是推进大集成、培育大成果。结合专项“十一五”和“十二五”的任务布局和已有成果，在专项2016年度计划安排中，进一步加大用户牵头和项目策划比重，任务及经费向专项关联目标带动性强的行业重点企业集中与倾斜，落实航空、汽车、机床制造装备的规模化、成套化示范应用与验证，提高机床及成套装备运行可靠性，在标志性成果的基础上，围绕专项实施方案和总体目标，推进大集成、培育大成果、打通专项成果产业化路径。
三是发挥企业创新主体作用，提升企业创新能力。在产品类课题由企业牵头的基础上，进一步发挥企业的创新主体作用，在用户使用的基础上鼓励供方企业与上游用户共同开展装备成套研发、工艺研究、系统集成等良性互动，促进创新链到产业链的升级及成果共享机制的形成，解决创新碎片化的弊端。
四是探索多元化资金投入机制，加大“后补助”财政支持比例。建立重大专项资金配套来源的选择机制，在专项重点任务安排中，突出成果导向，对主机、系统部件、共性技术采用不同比例的配套经费要求，鼓励和引导社会力量自主投入，积极参与数控机床专项。
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